Okres Malacky leží v Bratislavskom, tvorí jeho celú severnú časť. Má rozlohu 949 km2, žije tu 70 964 obyvateľov a priemerná hustota zaľudnenia je 75 obyvateľov na km2. Správne sídlo okresu je mesto Malacky. Okres sa nachádza v juhozápadnej časti Slovenska, v regióne Záhorie. Zaberá južnú časť Záhorskej nížiny, na západe ho ohraničuje rieka Morava, ktorá je i hraničnou riekou s Rakúskom a na východe sú to hrebene Malých Karpát. Na severe hraničí s okresmi Senica a Trnava, na juhu s Pezinkom a Bratislavskými okresmi Bratislava III a Bratislava IV.